我国构建起现在全球最完好海洋微生物基因数据库

09-06 349阅读 0评论

  中新社青岛9月5日电 (胡耀杰 张孝鹏)“千种海洋生物基因测序项目”暨全球海洋微生物基因库建造及使用作用联合发布会5日在山东青岛举办。记者从会上得悉,华大生命科学研讨院与山东大学等一起构建了现在全球最完好海洋微生物基因数据库The Global Ocean Microbiome Catalogue(GOMC),并从中发现很多有使用潜力的基因资源。

  据华大生命科学研讨院研讨员范广益介绍,GOMC是已揭露海洋基因组数据库Tara Ocean的3倍、蛋白序列库的60倍。现在,GOMC已存储于我国的国家基因库生命大数据渠道,对具有使用潜力基因资源的相关研讨作用已在学术期刊《天然》(Nature)上宣布。

  据介绍,GOMC的构建过程中,科研人员对现在已揭露的近240Tb海洋微生物宏基因组数据进行了重剖析。GOMC具有超4.31万个海洋微生物基因组和24.58亿个基因序列,其中有2万余个微生物是潜在新发现物种,近1万个微生物是在一起生境中初次发现。

  GOMC的研讨过程中,科研人员挖掘出1个具有潜在使用价值的新式Cas9修改体系(Om1Cas9),将助力我国在基因修改东西使用上具有更多独立性和挑选;发现10个具有明显抗菌活性及广谱抗菌作用的新式抗菌肽,该作用的使用或将为抗生素耐药性难题供给新解决方案;开掘3个深海来历的高活性新式嗜盐PET塑料降解酶,或将助力完成PET塑料的绿色低碳可继续使用。

  据悉,GOMC是我国(山东)自贸试验区青岛片区与华大生命科学研讨院所属青岛华大基因研讨院一起展开的“千种海洋生物基因测序项目”重要组成部分。“千种海洋生物基因测序项目”主要内容为海洋生物的基因样本收集、高深度基因组测序等。(完) 【修改:付子豪】

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